救世軍石湖學校前名為救世軍荔景學校，於一九七九年至八九年間建校於荔景。
一九八九年遷至上水，並易名救世軍石湖學校。
一九九零年二月遷入上水臨時校舍，直至一九九五年工程完竣而擁有整座正式校舍。
學校於二零零四年完成學校改善工程和增建新翼大樓，為學校與社區關係和學生全人發展為目標。為使學生有更佳的學習環境及康體發展，運動場及露天休憩場地亦於二零零六年九月落成，使本校發展更為完備。
2010年—現今：
現在，救世軍石湖學校不僅是一所專為有特殊教育需要輕度智障學童提供六年小學及六年中學一貫課程之輕度智障學校，也是一所由教育局批准成為支援區內(由大埔至北區)甚至全港普通中小學的資源中心。
為配合特殊學校發展新高中課程及政策，學校已於二零一四年八月完成校舍擴建工程，學校在新一個發展階段和成果中增設了一個特別室及三個課室的設備。